分娩困难是巨大胎儿主要的并发症。由于胎儿体积的增大，胎头和胎肩是分娩困难的主要部位。由于难产率明显增高，带来母儿的一系列并发症。
1.头盆不称 由于巨大胎儿的胎头较大，造成孕妇的骨盆相对狭窄，头盆不称的发生率增加。在胎头双顶径较大者，直至临产后胎头始终不入盆，若胎头搁置在骨盆入口平面以上，称为骑跨征阳性，表现为第一产程延长;若双顶径相对小于胸腹径，胎头下降受阻，易发生第二产程延长。由于产程延长易导致继发性宫缩乏力;同时巨大胎儿的子宫容积较大，子宫肌纤维的张力较高，肌纤维的过度牵拉，易发生原发性宫缩乏力;宫缩乏力反过来又导致胎位异常、产程延长、产后宫缩乏力、软产道裂伤、产后出血等并发症增加。由于难产率升高，剖宫产和阴道手术产(产钳、吸引器)的发生率增加。在落后地区若不及时处理，可以发生子宫破裂;在城市中可因预防难产而使巨大胎儿的剖宫产率增加。
2.肩难产 巨大胎儿经阴道分娩者，肩难产的发病率增加，特别是糖尿病的巨大胎儿。Rouse等报道非糖尿病妊娠的新生儿出生体重<4000g 1="" 4000g="" 4500g="" 7="">4500g者，肩难产的发生率为15%。但是，在妊娠期糖尿病患者中，三组的肩难产的发生率分别为1.2%、14%和50%。
肩难产若处理不当，或时间延迟，可以发生严重的并发症，甚至危及生命，如新生儿窒息、胎粪吸入综合征以及各种产伤。头部损伤可有头皮血肿、颅内出血、面神经瘫痪、臂丛神经损伤、锁骨骨折、肱骨骨折等，甚至发生膈神经损伤。
3.新生儿疾病 由于妊娠期糖尿病的患者易发生巨大胎儿，因此，糖尿病的胎儿或新生儿的并发症均可发生在巨大胎儿。
妊娠期糖尿病或妊娠合并糖尿病孕妇的胎儿因长期的高血糖环境，其胰腺的分泌功能亢进，分娩后若不及时补充能量，新生儿易发生低血糖，严重者危及新生儿的生命或不可逆的脑损伤。由于高浓度的胰岛素可降低3-磷酸甘油和双氧丙酮的浓度，从而抑制磷脂的合成，易发生新生儿呼吸窘迫征。另外，低钙血症、高胆红素血症、红细胞增多症等发病率在巨大胎儿中增加。