1、加强支持疗法，有原发感染灶者尽早清除。
2、抗菌素治疗：应早期、联合、长疗程，选用青霉素G或万古霉素;对耐青霉的金葡菌可选用苯唑青霉素、头孢菌素类，或与新一代喹诺酮类抗菌素合用。抗菌药物至少用4周以上。
3、大多数金黄色葡萄球菌产生青霉素酶，且对甲氧西林的耐药性正在增加。一般主张用一种能抗青霉素酶的青霉素(如苯唑西林或萘夫西林2g，静脉注射，每 4～6小时1次。另一类主要药物是头孢菌素：常用的为头孢噻吩或头孢孟多2g，静脉注射，每4～6小时1次，头孢唑啉0。5～1。0g，静脉注射，每8小时1次，或头孢呋辛750mg，静脉注射，每6～8小时1次。第三代头孢菌素的效果不如第一代或第二代制剂。林可霉素600mg静脉注射，每6～8小时1 次对90%～95%菌株有效。
4、一般认为，对甲氧西林耐药的菌株，对所有β-内酰胺抗生素均有抵抗力。在许多医院，此类菌株占医院获得性葡萄球菌的30%～40%，而仅占社区获得性感染的5%。如怀疑或经体外药敏试验证明对甲氧西林耐药，一般用万古霉素。常用剂量为1g静脉注射，每 12小时1次;有肾功能衰竭时适当调整用量。