本病在小儿较多见。急性肠系膜淋巴结结核时，患者持续性低热、疲倦不适。脐部或右下腹常有持续性隐痛，有时阵发性加剧，也可表现为急腹痛，类似绞痛，伴恶心、呕吐。可有腹泻或便秘。体检时脐周或左上腹、右下腹可扪及肿大的淋巴结，有压痛，常疑为急性阑尾炎而施行手术。
慢性肠系膜淋巴结结核时，可出现慢性中毒征状和营养不良，表现为长期不规则低热、食欲减退、消瘦、贫血、乏力、腹泻。有时可扪及团块状肿大的淋巴结，比较固定，不易推动。肿大的淋巴结可压迫门静脉使回流受阻，产生腹水及腹壁静脉曲张；压迫下腔静脉引起下肢水肿；压迫幽门致幽门梗阻；压迫肠道致不完全性肠梗阻。在成人，可缺乏临床症状，而表现为脐周扪及腹块，剖腹探查时始发现为淋巴结结核。