本病主要是兼具颈椎与腰椎椎管的脊髓或马尾神经受刺激或受压所致的各种症状，主要是与颈椎病、腰椎间盘脱(突)出症以及与锥体束受累的某些疾患等相鉴别：
1.脊髓侧索硬化症 较为常见，颈腰综合征因同时引起上、下肢肌力减弱或瘫痪而易与本病相混淆。但本病的全过程中不伴有感觉障碍，患者发病年龄较轻，肌力减弱及肌萎缩较明显，颈椎与腰椎的椎管多无狭窄，且亦无腰椎椎管狭窄症所特有的三大临床症状，只要认真检查，一般易于鉴别。
2.脊髓空洞症 由于感觉症状较多，亦易与颈腰综合征混淆。但脊髓空洞症患者大多伴有感觉分离及营养性障碍，无腰椎椎管狭窄症的三大临床症状，易于区别。MRI检查有利于鉴别。
3.周围神经炎 大多为各种原因所致的中毒与各种感染后所引起的末梢神经炎性改变，患者主要表现为双侧对称性感觉、运动及自主神经功能障碍，且无脊髓性受压及腰部三大症状，一般容易鉴别。
4.继发性粘连性蛛网膜炎 本病除可继发于各种因素，包括医源性因素外，长时间的椎管狭窄亦易继发本病。前者可根据原发伤患加以鉴别，后者则较难以区别，尤其是后期病例，常需依据MRS(脊髓磁共振)或脊髓造影等影像学检查加以判定。对需行手术的病例，可在术中进行硬膜囊穿刺等检查加以证实。
5.脊髓痨 为晚期梅毒所致，以感觉障碍为主，目前甚为少见。本病患者具有冶游史、血液康华阳性及夏科关节等特征，一般易于鉴别。
6.其他 包括多发性硬化症、广泛性颈肩及腰骶部筋膜炎、骨质疏松症及退变性脊椎炎等，均应注意鉴别。