1.颈椎病：无明确外伤史，或在外伤前即有颈椎病的症状，起病缓慢，症状、体征可与颈椎间盘突出症相似，影像学显示骨赘和椎间盘共同构成致压物，且往往以前者为主。
2.颈椎管内肿瘤：无外伤史，起病一般较缓慢，影像学可提供重要的鉴别依据，髓内肿瘤分辨较容易，髓外肿瘤与椎间盘有明确界限。
3.肩周炎、胸腔出口综合征：主要与侧方型颈椎间盘突出症相鉴别。肩周炎仅有肩部疼痛及活动受限，而无神经功能异常。胸腔出口综合征的临床表现酷似侧方型颈椎间盘突出症，但颈椎MRI却未见椎间盘突出及神经根受压，胸片可显示胸腔上口狭窄或颈肋等。