本病诊断困难，为确定诊断需要活体组织检查。需与Wegener肉芽肿及转移性肿瘤等下列疾病相鉴别：
1.淋巴瘤 该病也常见血管浸润及广泛坏死，LG患者主要表现为纵隔增大,肺门淋巴结肿大以及肝、脾、浅表淋巴结肿大时需和恶性淋巴瘤鉴别。鉴别还是靠病理，淋巴瘤浸润的细胞较为均一，免疫组化染色检测为单克隆性。而LG主要表现血管坏死性肉芽肿，伴有各种类型的细胞浸润，免疫组化显示淋巴细胞主要为CD4 阳性的T细胞，TCR基因克隆性重排(-)，两者显然不同。以下特点可与LG区别：
(1)常伴浅表、肺门、纵隔淋巴结及肝脾肿大。
(2)浸润细胞常为单一种细胞。
(3)免疫过氧化物酶检查为单克隆免疫球蛋白，而LYG为多克隆免疫球蛋白。但LG中如发现灶性单一异型淋巴细胞浸润时应警惕其发展为恶性淋巴瘤的可能。
2.韦格内肉芽肿(Wegener肉芽肿WG) 与LG相似，肺部受累最为常见。但本病临床上更为少见，无性别差异，以40～50岁多见。患者除有发热、关节痛、肌肉痛、贫血、白细胞增多、血沉增快外，呼吸道症状早期表现为鼻、中耳、鼻窦的炎症及咽喉、支气管的溃疡性损害。在中、末期出现灶性肾小球肾炎，皮肤及黏膜广泛性出血性皮疹，弛张热，多因尿毒症或全身衰竭而死亡。病程平均约6个月，多在3个月以内，十分凶险。此病虽和LG均有血管坏死性肉芽的病理特点，但WG具有特征性的多核巨细胞、肉芽肿常有较多的中性粒细胞及细胞碎屑，而淋巴细胞较疏松，且凝固性坏死少见。另外，血清中抗中性粒细胞抗体(ANCA)阳性是诊断WG的重要依据，其特异性为86%，敏感性为78%，可与LG相鉴别。病理上浸润细胞主要由中性粒细胞、组织细胞及少量嗜酸粒细胞组成，并间杂有稀疏的淋巴细胞和浆细胞群，无淋巴瘤样肉芽肿出现的特征性非典型性淋巴网状细胞浸润明显的增生活跃现象。韦格内肉芽肿在浸润灶内或其附近可见有嗜酸粒细胞，而淋巴瘤样肉芽肿浸润灶无此改变。另外，类上皮样细胞和巨细胞是韦格内肉芽肿常见的组织学特征，但很少见于淋巴瘤样肉芽肿。其他肺血管炎和肉芽肿病LG和Wegener肉芽肿鉴别困难，但后者浸润细胞无异型淋巴细胞。
3.感染性肉芽肿病 在确定LG之前仍需除外分枝杆菌、真菌等感染性疾病所致的肉芽肿病。
4.阻塞性支气管炎 由于肉芽肿病变破坏支气管壁及纤维增生而造成管腔狭窄或闭塞，可误诊为阻塞性支气管炎。必须取肺组织活检以排除阻塞性支气管炎。
5.肺转移性肿瘤 肺转移性肿瘤也常可表现为肺部多发性结节，当尚未发现原发灶时应与LG鉴别。转移性肿瘤的结节常为圆形，边缘清晰、光滑，密度均匀，无空洞，一般无大片浸润影。而LG常表现为伴有空洞的结节形成，可见到肺大片浸润性阴影。病理上两者截然不同。肺转移瘤大多可查到原发灶，如肝、前列腺、乳腺等，伴有原发病灶的症状可资鉴别。
