不同类型肺结核的X线表现各异，需要鉴别的疾病也不同。
1.原发型肺结核 X线特征表现为纵隔和肺门淋巴结肿大，需要与淋巴瘤，主要包括淋巴肉瘤、霍奇金病和淋巴性白血病、胸内结节病、中心型支气管肺癌、纵隔淋巴结转移癌和各类纵隔肿瘤鉴别。
2.血行播散型肺结核 重度毒血症状而早期X线特征显示不清楚时当与伤寒、败血症相鉴别。肺部粟粒病变须与细支气管肺泡癌、肺淋巴管癌、肺部转移癌、含铁血黄素沉着症、各类肺泡炎等进行鉴别。
3.浸润型肺结核与各类细菌性和非细菌性肺炎易于混淆。肺结核空洞须与肺脓肿、癌性空洞等加以区别。肺结核薄壁空洞须与肺囊肿和囊性支气管扩张相鉴别。肺部结核球应与肺癌、肺部良性肿瘤、肺部转移癌、肺部炎性假瘤、包虫病、动静脉瘘等加以鉴别。
4.慢性纤维空洞型肺结核 主要X线表现为肺纤维化，不规则的空洞，局部肺体积缩小，气管纵隔移位等。须与慢性肺脓肿、肺不张、明显的胸膜肥厚和放射性肺炎等作鉴别。
5.特殊人群和不典型肺结核 某些特殊人群患肺结核可在症状、体征和胸部X线表现及临床病程等方面与一般肺结核患者有不同特点，称为“不典型肺结核”易延误诊断。
(1)无反应性结核：亦称暴发性结核性败血症。为一种严重的单核-巨噬细胞系统结核病，见于极度免疫功能低下患者。首先出现持续高热、骨髓抑制或呈类白血病反应。肝、脾、淋巴结、肺、肾、骨髓严重干酪性坏死病变、含有大量MTB，而X线表现往往很不明显，出现时间明显延长或长时间表现为无典型的粟粒样病变改变，呈均质性片絮状阴影，常位于非结核病好发部位。
(2)结核性关节风湿症与结节性红斑等变态反应性表现：多见于年轻女性，多发四肢大关节疼痛或炎症。四肢伸侧面及踝关节附近反复出现结节红斑及环形红斑、春季好发，抗结核治疗有效。
(3)艾滋病合并肺结核时可表现为肺门、纵隔淋巴结肿大、中下肺野浸润病变多，并缺乏空洞等特征，类似原发肺结核表现，且有合并胸膜炎与肺外结核多见、PPD试验阴性等特点。
(4)糖尿病、矽肺合并结核时X线特点以渗出干酪为主，呈大片状，巨块状，易形成空洞，病变进展迅速，治疗效果差。尽早有效控制糖尿病同时予以抗结核化疗。否则，抗结核治疗难以奏效。
(5)肺结核合并肺癌：两者常合并存在，有报道肺结核纤维瘢痕组织可致癌变，肺结核合并肺癌可发生在结核邻近部位或肺部不相关部位。X线胸片出现新病灶，特别是孤立结节灶、肺不张、肺门增大、胸腔积液等征象应考虑合并肺癌的可能，作相应检查及早确诊。手术治疗为首选方案。抗癌化疗为姑息性治疗手段，放疗可促使结核恶化不宜采用。
(6)肺结核与妊娠分娩：肺结核患者伴妊娠，化疗药物选用应避免对胎儿的影响，INH，EMB，PZA对母亲与胎儿是安全的。RFP对动物有致畸作用，但在人类未被证实，故妊娠3个月内禁用，妊娠3个月后慎用。SM等氨基糖苷类抗生素禁用，以防止发生先天性耳聋。氟喹诺酮类药物对胎儿软骨发育有影响，ETH也有致畸作用，均不宜采用。药物在乳汁中浓度很低，产后可进行母乳喂养。肺结核患者妊娠后在化疗控制下不是人工流产的禁忌证。