1.胃癌 两者的鉴别有时比较困难。以下情况应当特别重视：①中老年人近期内出现中上腹痛、出血或贫血;②胃溃疡患者的临床表现发生明显变化或抗溃疡药物治疗无效;③胃溃疡活检病理有肠化生或不典型增生者。临床上，对胃溃疡患者应在内科积极治疗下，定期随访内镜检查，直至溃疡愈合。
2.功能性消化不良(或称非溃疡性消化不良) 这些患者常有上腹疼痛、反酸、嗳气、烧心、上腹饱胀、恶心、呕吐、食欲减退等消化不良症状。部分患者可有典型的消化性溃疡症状，但内镜检查并无溃疡病灶。鉴别诊断主要依靠内镜检查。
3.慢性胆囊炎和胆石症 疼痛与进食油腻有关、位于右上腹、并放射至背部，典型病例伴发热、黄疸，不难鉴别。对症状不典型的病人，鉴别需借助腹部B超或内镜下逆行胆管造影检查。
4.胃泌素瘤 本病又称Zollinger-Ellison综合征，有顽固性多发性溃疡，或有异位溃疡，胃次全切除术后容易复发，多伴有腹泻和明显消瘦。患者胰腺有非β细胞瘤或胃窦G细胞增生，血清胃泌素水平增高，胃液和胃酸分泌显著增多。
