病毒侵入细胞内,在细胞核内繁殖，其复制和扩散可直接引起感染细胞损伤。该过程可能由机体免疫反应介导，病理改变出现黏膜出血、水肿渗出及细胞浸润，部分细胞发生变性、坏死和脱落，胞质及胞核内可见包涵体。
腺病毒直径约60～90nm由核心和衣壳组成20面体结构。核心由线性双链DNA及其他4种相关蛋白组成，衣壳由12种蛋白质共252个子粒组成，其中240个子粒是六邻体，12个子粒为五邻体，五邻体由1个纤维及多边的基部和纤维远端的结节组成五邻体和六邻体都具有特异性抗原决定簇。自1953年分离到腺病毒以来，已经发现了6个亚组47个血清型。能够引起眼部疾病的主要有D组(8，19和37型，少数由9，l0，13，15，20，22～24，29型引起)C组(1，2，5，6型)，B组(3，7，少数由11，14，16，21型引起)和E组(4型)。共有19个血清型可引发腺病毒感染性眼病，和血清型密切相关的临床症状有流行性角结膜炎(Ad8，9，37)咽结膜热(Ad3,7)，非特异性滤泡性结膜炎(Ad1，2，4，5，6)。尽管血清型和临床表现有密切的关联，但仍有很多例外，并且许多血清型可导致轻微滤泡性结膜炎
1、腺病毒(adenovirus，Ad)是一群十分广泛的DNA病毒，主要在细胞核内繁殖。除了感染结膜、角膜上皮及咽、淋巴组织外，还能在肠道繁殖。迄今总共发现80个血清型，其中感染人的有21个血清型，其中EKC是由Ad7，8，1937型引起;咽-结膜热是由Ad3，4，7型引起;一般滤泡性结膜炎是由Ad1～11，14～17，19，20型引起。
2、EKC、PCF结膜炎和表层点状角膜炎是Ad感染的直接结果;上皮下浸润则为免疫反应所引起。