1.结核性膀胱炎 凡原因未明的慢性膀胱炎症状长期存在并逐渐加重，都应排除泌尿系结核菌素(tuberculin，TB)可能。一般血、脓尿明显，可行尿沉渣或查抗酸杆菌，并行IVU检查明确肾结核病变。
2.间质性膀胱炎与腺性膀胱炎 有尿路刺激征，前者膀胱充盈时有剧痛，但尿液清。尿常规检查脓细胞少，尿培养urine bacterial culture(-)。膀胱镜活检可确诊。
3.女性尿道综合征 有尿路刺激征，无发热、腰痛，尿常规无异常，尿沉渣涂片uropsammus counting(-)，尿培养urine bacterial culture(-)，膀胱镜检cystoscopy(-)。
此外尚有非细菌性前列腺炎、放射性膀胱炎等、可根据病史临床表现予以鉴别。