13岁阴茎短小可能是激素失衡、发育延迟、肥胖等原因导致的。不同的人有不同的发育速度，因此阴茎的大小也会有所不同。

1、激素失衡：激素水平失衡可能影响阴茎的发育。

2、发育延迟：有些人可能会比同龄人晚一些开始发育，这可能导致阴茎较小。

3、肥胖：肥胖可能导致阴茎周围脂肪堆积，从而使阴茎显得短小。

除此之外，阴茎短小还可能是尿道下裂、阴茎短小症、遗传因素等原因引起的。阴茎大小不是衡量一个人健康状况的唯一标准。一个健康的人不仅仅取决于阴茎的大小。