急性尿道损伤的可能并发症有狭窄形成，感染，勃起障碍和尿失禁。
1.前尿道损伤：海绵体损伤可在会阴部或尿道口出现大出血。压迫会阴部出血部位可控制出血。当出血难以控制需急诊手术。尿外渗的并发症主要是感染及败血症。出现感染后需彻底清创，充分引流。损伤部发生狭窄是常见的并发症，但不一定需要手术重建，除非严重狭窄，尿流率明显降低。
2.后尿道损伤：狭窄、阳痿和尿失禁是前列腺膜部尿道损伤最严重的并发症。一期修补及吻合后出现的狭窄可见于半数病例。若先行耻骨上膀胱造瘘而稍后行修补术，那么狭窄的发生率可减少 5%。一期修补术后出现阳痿见于30%～80%的病人，平均约50%。然而推迟做尿道重建仅先行耻骨上引流，可使阳痿发生率减少10%～15%。一期行重建吻合术者约1/3出现尿失禁，推迟重建术使之减少到5%以下。