(一)发病原因
泌尿系结核与男性生殖系结核关系密切，双侧射精管及前列腺小管均开口于后尿道，感染的尿液通过前列腺尿道时，可进入前列腺及精囊，引起感染，所以临床上常见泌尿系结核并发男性生殖系结核。
但男性生殖系结核究竟是来自肾结核还是主要由原发感染经血行播散引起，则仍存有争论，现在认为临床上常见的肺尖部结核、骨结核、肾结核、结核性脑膜炎等都是在原发感染时，结核菌经血行播散到达该处的，故认为男性生殖系结核也可能为原发感染的血行播散。附睾尾部的结核，一向认为是经前列腺、输精管到达附睾尾的，而支持血行播散的作者，通过附睾血管造影Macmillan(1954)发现附睾尾的血管比其他附睾部位的血运都丰富。Gow(1986)曾对20例已经证实的附睾结核患者行前列腺活检，结果只1名患者诊断有前列腺结核，虽然活检取材不多，可能遗漏了病变，但20例中只1例为结核，也颇能说明附睾尾的结核来自血行的可能性很大。有时附睾结核为患者惟一的症状，泌尿系造影及尿结核菌培养均为阴性，而附睾病变及窦道中可培养出结核杆菌。以上资料，说明二者均能引起男性生殖系感染，但以何者为主，尚待进一步的研究。睾丸结核多是附睾结核的直接蔓延，也可由血行感染引起。睾丸结核无附睾受累者很罕见，无法与肿瘤鉴别，如对抗结核治疗无效，应早行探查。
(二)发病机制
1.前列腺和精囊 早期结核菌在前列腺腺管中或精囊腺内形成结核结节，其后逐渐向精囊或前列腺实质内扩散。前列腺结核形成结核性肉芽肿，后者可融合发展为干酪样变，形成空洞，纤维化收缩后形成不光滑硬结状肿块，若发生钙化则前列腺更为坚硬。精囊结核纤维增生形成坚硬的肿块，发生干酪样变而形成空洞者较少见。精囊瘢痕有时可于膀胱后方引起输尿管梗阻。偶有结核病变破溃至前列腺周围，甚至穿破会阴或阴囊部皮肤形成窦道;也可导致后尿道狭窄、排尿困难。血行感染者，首先在前列腺被膜下或前列腺实质内形成病灶，严重者形成寒性脓肿，可于会阴部破溃形成窦道，纤维化致后尿道狭窄。
镜下可见多个结核结节，伴巨噬细胞浸润，前列腺主质细胞，导管上皮细胞破坏、消失，部分被纤维组织替代，其间可见干酪样脓肿及肉芽肿样变。
2.附睾和睾丸 主要病变为干酪样变和纤维化，结核侵犯输精管时，管壁增厚，输精管变硬变粗呈串珠状。病变可沿输精管蔓延到附睾尾，然后波及整个附睾和睾丸。镜下早期病变可见附睾小管内含有脱落的上皮细胞、白细胞及大量的结核杆菌，继之出现小管坏死，形成肉芽肿、干酪样变及纤维化。偶可于附睾内见到精子肉芽肿。血行播散时，病变先位于附睾间质内，可见多数粟粒样微小的肉芽肿，然后侵犯附睾管，输精管多无明显改变。附睾的干酪样变很快蔓延到附睾之外，与阴囊粘连、形成寒性脓肿，破溃流脓，经久不愈。附睾结核可直接蔓延至睾丸，引起睾丸结核。睾丸固有鞘膜受累时，可有少量渗出液，睾丸固有鞘膜可阻止结核侵犯睾丸，常可见到附睾已完全破坏，而睾丸尚完好无损。