本病须与急性干酪性肺炎、支气管扩张和其他细菌引起的肺炎相鉴别。如：金黄色葡萄球菌肺炎：由金黄色葡萄球菌感染引起，表现为：起病急、寒战、高热、脓血痰、气急、毒血症症状、休克。x线平片示：肺叶或小叶浸润，空洞，脓胸，液气囊腔。临床表现及x线胸片及微生物学检查可资鉴别。 克雷伯杆菌肺炎：由克雷伯杆菌感染引起，表现为，起病急、寒战、高热、全身衰竭、咳砖红色胶冻样痰。x线平片示：肺叶、段实变，蜂窝状脓肿，叶间隙下坠。临床表现及x线胸片及微生物学检查可资鉴别。
胃肠炎型需与其他病原引起的腹泻相鉴别。如消化不良引起的腹泻：由于饮食无规律、进食过多、进食不易消化的食物，或者由于胃动力不足导致食物在胃内滞留，引起腹胀、腹泻、恶心、呕吐、返酸、烧心、嗳气等症状。病原学检查以资鉴别。