屈光参差性弱视的发病机理是由于两眼的屈光度数相差较大，外界景物在左右两眼黄斑部所成的象大小不等，清晰度不同，造成两眼物象的融合困难。为了消除互相间的干扰，视皮层中枢只能主动抑制屈光度数较大的眼，屈光参差性弱视所以往往形成单眼弱视。