(一)发病原因
食管镜检查发生的损伤多见于颈段食管，常是技术不熟练，致穿孔部位常发生在健康组织的咽后壁或咽食管憩室处。造成食管憩室处损伤的危害因素包括短宽的颈部、颈椎僵直、骨关节骨刺及不良的牙列。应用硬质食管损伤穿孔率较高，多发生在环咽肌部位的食管壁因为在咽部推进食管镜时，要由垂直位改变到水平位，后方为椎体，造成压迫食管后壁及撕裂。气管内插管及插双腔管时亦可损伤环咽肌远端的食管后壁，气管套囊长期压迫食管亦可发生穿孔。在食管狭窄及贲门失弛缓症的病人中应用探子或气囊扩张可造成狭窄部或食管远端穿孔。气囊扩张造成的食管破裂先发生在肌层，后再有黏膜层的线形穿孔。用水银扩张器最安全，发生食管穿孔的危险性较低。扩张器进入太快或扩张次数太频繁，亦可使并发症发生率增高。每次扩张应间隔1～2周，每次扩张不超过3个号。有病变的食管，在扩张时亦易穿孔，如食管纤维化狭窄的程度及有无合并食管憩室或裂孔疝。食管在施行吸引活检后因易发生穿孔，不要立即行扩张术，但如用浅的钳夹，则无此危险。
(二)发病机制
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