早期乳房结核尚难与乳腺癌区别。Hinton报道8例中，4例误诊为乳腺癌而行根治手术。Shpley与Sencer报道10例，5例误诊。叶宗典报道，门诊半数误诊为乳腺癌。另有文献报道88例乳房结核中，误诊为乳腺癌者51例，占57.9%;仅有9例诊断为乳房结核，占10.2%;诊为良性肿瘤及炎症的为16例(18.3%)及12例(13.6%)。说明本病早期诊断之不易，因此必须注意鉴别诊断。
1.乳腺癌 与乳腺癌相比乳房结核有下列特点：
(1)多见于中青年，20～40岁发病，尤以妊娠和哺乳妇女多见。且病史较长，进程缓慢。
(2)部分病例有原发灶，如肺门淋巴结核、腋窝或颈淋巴结核、胸壁及脊柱淋巴结核等，而乳腺癌与此并存者极少。
(3)半数以上有慢性炎症表现，局部皮肤破溃，窦道形成。排出物为稀薄、豆腐渣样的脓液，无恶臭。乳腺癌溃疡呈菜花样或边缘高起基底凹陷的恶性溃疡，有别恶臭味。乳房结核窦道流出物涂片作抗酸染色，可查到结核杆菌。
(4)乳房结核早期病变发展较快，局部反应重，淋巴结肿大出现较早，但质地较软;乳腺癌相对发展较缓，但病程较短，多无疼痛，腋下淋巴肿大且硬。
(5)硬化性乳房结核虽然也有乳头内陷、肿块与皮肤粘连、无痛等与乳房硬癌很相似的临床表现，但是乳房结核的易发年龄较乳腺癌要小10～20岁。
(6)X线有边界不清的结节状阴影，并有片状钙化点。
(7)病理组织学检查有助于鉴别乳腺癌，明确诊断。
2.乳房脂肪坏死
(1)乳房脂肪坏死的局部表现有类似结核之处，但乳房脂肪坏死病人，多见于肥胖的中老年女性，一般可查到外伤史，伤处皮肤出现瘀斑。
(2)乳房脂肪坏死的乳内肿块切面可见油囊，囊内可见液化的脂肪或咖啡色血性液体;乳房结核病变组织内有典型干酪样坏死，可查到结核杆菌;病理组织切片可见到典型的结核结节;而乳房脂肪坏死的病理组织中则无此改变。
(3)乳房脂肪坏死不形成慢性溃疡及窦道和寒性脓肿。
3.乳腺丝虫病
(1)乳腺丝虫病多见于丝虫病流行区女性。
(2)乳房肿块内可查到丝虫虫体残段及出血。
4.乳腺结节病
(1)乳腺结节病多侵犯真皮全层，很少侵犯深部组织。表皮出现湿疹样小丘疹，皮肤增厚粗糙，丘疹中心消退可使损害呈环状。
(2)乳腺结节病的乳内无硬结，无脓汁，不形成窦道。
(3)X线摄片可见明显的结核瘤样影像或巨大肿块，周边有不清的钙化。
(4)乳腺结节病病理组织切片上见不到干酪样坏死。
(5)乳房结核的结核菌素实验呈阳性反应。