1.妊娠期高血压疾病 肾型SLE患者和妊娠期高血压疾病患者均可以出现水肿、高血压、蛋白尿。脑型SLE可以发生癫痫，与严重妊娠期高血压疾病的子痫抽搐发作的临床表现难以区分，由于两种疾患处理方法不同，进行鉴别尤为重要，通过化验检查可以区分：
(1)SLE患者免疫指标(如ANA等)阳性，妊娠期高血压疾病患者免疫指标阴性。
(2)血清补体如C3、C4、C50在妊娠期高血压疾病时是升高的，SLE活动时补体是降低的。
(3)妊娠终止，妊娠期高血压疾病立即缓解，SLE不能缓解。
鉴别妊娠期高血压疾病与SLE病情加重很有必要，因为妊娠期高血压疾病的根本措施是终止妊娠。如SLE病情加重，则治疗方法有所不同，需要增加泼尼松用量或用其他免疫抑制剂。
2.贫血 妊娠期最多见的是缺铁性贫血，营养性贫血，通过补充铁剂、叶酸、调整饮食，多数能纠正。SLE患者贫血可能是免疫引起的溶血性贫血，患者为正常色素，正常细胞贫血，并且常常伴有血小板减少。SLE免疫抗体指标阳性，抗人球蛋白试验呈阳性;营养性贫血免疫抗体指标阴性，抗人球蛋白试验呈阴性。
3.原发性血小板减少性紫癜 约有25%的SLE患者发病时有血小板减少，被误认为原发血小板减少性紫癜。通过骨髓穿刺进行区分，SLE患者巨核细胞不减少;原发血小板减少性紫癜巨核细胞减少。进行抗核抗体及其他免疫学检查，如免疫指标阳性支持SLE，如阴性可以排除SLE。
4.淋巴结肿大 有5%SLE患者以淋巴结肿大起病，淋巴结大小可达2～4cm直径，并且伴有低热。淋巴结活体病理检查，排除淋巴结结核及霍奇金病。