需与精神分裂症、其它症状性癫痫和脑膜脑炎、代谢性和中毒性脑病、颅内占位性病变以及急性播散性脑脊髓炎鉴别。
癫痫：以癫痫为突出症状伴有脑电图异常改变，而无发热或头痛症状不明显者，常被误诊为癫痫。
结核性脑膜炎：当头痛、发热症状突出，脑脊液改变不典型，如细胞及蛋白有中度增高，以淋巴细胞为主，生化又有轻度改变时，易误诊为结核性脑膜炎。
神经症：如果散发性脑炎病程中的主要表现为头痛而无精神症状和抽搐，或其他神经症状较轻，且无明显的颅内压增高或脑膜刺激征象时，易误诊为神经症。
颅内肿瘤：颅内占位病变型散发性脑炎，主要表现为局灶性脑损害，很快出现颅内压增高征象，易误诊为脑脓肿、转移瘤或恶性胶质瘤等占位性病变。
