1.脑器质性和躯体疾病 神经衰弱症状常见于各种脑器质性疾病，如脑动脉硬化、颅内占位病变、颅内感染、颅脑损伤后;各种急、慢性工业中毒;以及各种慢性躯体疾病，如肺结核、溃疡病、慢性肝炎、鼻窦炎、甲状腺及肾上腺疾病等。如果神经衰弱症状发生于上述疾病之后，则应诊断为上述相应的脑或躯体疾病。
2.重性精神病 神经衰弱症状可见于精神分裂症和抑郁症等重性精神病的早期、病程中和缓解期。这类患者早期可有神经衰弱症状，往往不主动关心自己的健康，不积极要求治疗，并有相应的精神病性症状存在，可资鉴别。
3.其他神经症性障碍 神经衰弱症状也常见于焦虑障碍、恶劣心境、躯体化障碍、疑病症等。如果患者有这类疾病的典型症状，按等级制诊断原则，不再诊断为神经衰弱，而诊断为各种相应的疾病。
这里需特别提到适应不良问题，尤其是大学生远离家乡、亲人，学习方法与中学不同，生活环境也不一样。特别在寄宿制学生中，对集体生活感到很不习惯，发生类似神经衰弱症状群，其实都是适应不良。以往对适应不良认识不足，颇多被诊断为神经衰弱。有些患者到处求医、服药，但效果不佳，而经心理治疗，短程心理分析，疗效显著。
4.疲劳反应 正常人在脑力或体力过度劳累之后，常会产生疲劳反应，出现头痛、头昏、嗜睡、精力不足、注意力不集中、失眠、或烦躁、易怒等症状。但这些症状历时短暂，引起疲劳的因素消除后，经过充分休息，即可迅速恢复常态;一般并不引起患者过分烦恼或不愉快的情感体验。如果工作负担已减轻，适当休息之后，上述症状仍持续存在，或时轻时重，迁延不愈，达3个月以上者，则应诊断为神经衰弱。在流行学调查时，除要求符合症状学标准和严重程度标准外，病程必须持续达3个月以上，对排除其他疾病是非常重要的。
5.慢性疲劳综合征 慢性疲劳综合征 (chronic fatigue syndrome)这是美国疾病控制中心(Centers for Disease Control，CDC)建议使用于一类病因未明，以慢性疲劳为特征的综合病征的名称。
