【病原学】
引起手足口病的病毒主要为肠道病毒，我国以柯萨奇病毒A组16型(Coxsackie virus,:CoxA16)和肠道病毒71型(enterovirus ，EV71)多见。肠道病毒属RNA病毒类的微小RNA病毒科，病毒颗粒小，呈20面体立体对称球形，直径约24～30nm。适合在湿热的环境中生存，不易被胃酸和胆汁灭活。该类病毒对外界有较强的抵抗力，在4℃可存活1年。因病毒结构中无脂质，故对乙酸、来苏、氯仿等消毒剂不敏感，但病毒不耐强碱,对紫外线及干燥敏感。高锰酸钾、漂白粉、甲醒、碘酒等能使其灭活。
【流行病学】
人类是已知的人肠道病毒的唯一宿主。手足口病患者和隐性感染者均为传染源，主要通过粪-口途径传播，亦可经接触患者呼吸道分泌物、疱疹液及污染的物品而感染，疾病流行季节医原性传播也不容忽视。是否可经水或食物传播目前尚不清楚。人群对肠道病毒普遍易感,但成人大多通过隐性感染获得相应的抗体，因此临床上以儿童患者为主，尤其容易在托幼机构的儿童之间流行。感染后可获得免疫力，但持续时间尚不明确。发病前数天，感染者咽部分泌物与粪便中就可检出病毒，粪便中排出病毒的时间可长达3~5周。
【发病机制】
手足口病(特别是EV71感染)的发病机制目前还不完全清楚。肠道病毒由消化道或呼吸道侵人机体后，在局部黏膜或淋巴组织中增殖，由此进入血液循环导致病毒血症，并随血流播散至脑膜、脑、脊髓、心脏、皮肤、黏膜等靶组织继续复制，引发炎症性病变并出现相应的临床表现。多数患者由于宿主的防御机制，感染可被控制而停止发展，成为无症状感染或临床表现为轻症;仅极少数患者,病毒在靶器官广泛复制，成为重症感染。对各种靶器官的趋向性部分决定于染病毒的血清型。近年来有研究证据显示，机体的细胞屏障，主要是巨噬细胞和T淋巴细胞功能，在EV71感染的过程中起到重要的作用。
