铜绿色假单胞菌广泛存在于自然界，又易污染药品、器材等，可通过多种传播途径成为医源性感染的病原菌。因此，必须严格执行消毒隔离制度，防止医院内交叉感染。菌苗预防仍在研究中，其确切效果尚在进一步观察。
1.早期发现病人，就地隔离治疗。
2.流行期间做好卫生宣传，应尽量避免大型集会及集体活动，不要携带儿童到公共场所，外出应戴口罩。
3.药物预防：国内仍采用磺胺药，密切接触者可用碘胺嘧啶（SD），分2次与等量碳酸氢钠同服，连服3日。在流脑流行时，凡具有：①发热伴头痛；②精神萎靡；③急性咽炎；④皮肤、口腔黏膜出血等四项中二项者，可给予足量全程的磺胺药治疗，能有效地降低发病率和防止流行。国外采用利福平或二甲胺四环素进行预防。利福平，连服5日。