诊断标准
大多数病毒性脑膜炎或脑炎的诊断有赖于排除颅内其他非病毒性感染，Reye综合征等常见急性脑部疾病后确立。
少数患者若明确地并发于某种病毒性传染病，或脑脊液检查证实特异性病毒抗体阳性者，可直接支持颅内病毒性感染的诊断。
根据临床起病比较迅速，以发热，头痛为主，有脑膜刺激征，CSF检查无色透明，白细胞呈轻，中度增多，且以单核细胞为主等改变，若患者缺乏脑主质损害的证据，不难考虑为病毒性脑膜炎，但仅就临床表现完全排除病毒性脑炎并非易事，特别是病情严重，发生神志障碍及抽搐者，即使脑部影像学检查提示脑主质并无损害也难完全排除。
既往在病原学的诊断中，多借血，CSF，咽拭子进行病毒细胞培养及分离，但需时且阳性率并非理想，目前多采用血清学检测柯萨奇，埃可及单纯疱疹等病毒抗体进行确诊，一般须在发病后数天方能测出阳性结果，且抗体可在血中存在数周，另从CSF或血中采用聚合酶链反应(PCR)技术检测病毒也有助于确诊病原。
鉴别诊断
夏秋季发病者应和日本乙型脑炎鉴别，后者脑CT或MRI多有基底核区病变，散发的患者在和单纯疱疹性脑炎鉴别时，除注意后者唇周常有疱疹外，脑CT和MRI常示颞叶及额叶腹侧有显著的损害，此外，尚需和结核性脑膜炎，真菌性脑膜炎，梅毒性脑膜炎及细菌性脑膜炎鉴别。
1.颅内其他病原感染 主要根据脑脊液外观，常规，生化和病原学检查，与化脓性，结核性，隐球菌脑膜炎鉴别，此外，合并硬膜下积液者支持婴儿化脓性脑膜炎，发现颅外结核病灶和皮肤PPD阳性有助结核性脑膜炎诊断。
2.Reye综合征 因急性脑病表现和脑脊液无明显异常使两病易相混淆，但依据Reye综合征无黄疸而肝功明显异常，起病后3～5天病情不再进展，有的患者血糖降低等特点，可与病毒性脑膜炎或脑炎鉴别。
