1.低分化腺癌 恶性度大的胃类癌之病理类型大多为溃疡浸润型，诊断易与低分化腺癌混淆，鉴别诊断需要靠病理电镜检查、嗜银染色以及免疫组化染色。胃低分化腺癌，细胞呈片巢状或不规则腺管状和乳头状排列，细胞大小极不一致，有较多的核分裂相和坏死，胃类癌细胞大小基本一致，核分裂相和坏死少见。低分化腺癌嗜银染色呈阴性反应，但有文献报道大约不到10%的胃类癌患者嗜银染色亦呈阴性反应，故对这类患者需要进一步靠免疫组化染色进行鉴别。
2.胃神经内分泌癌 鉴别需靠病理诊断，胃神经内分泌癌的瘤组织易广泛浸润，瘤细胞多呈片巢状排列，细胞为小梭形，胞浆少，形态似燕麦样有核分裂象和坏死。免疫组化染色可发现神经内分泌细胞达50%以上。
3.中肠的类癌 尿检出现高浓度的5-HIAA，而属于前肠类癌的胃类癌患者尿中5-HIAA含最较低。