1.与其他急性热病鉴别 如早期缺乏咳嗽和胸部体征，易与其他急性热病相混。
2.中毒性脑病 少数患儿出现头痛、颈强直等脑膜刺激症状，如同时有呕吐、头痛、谵妄或惊厥及昏迷等中毒性脑病的表现，则应与中枢神经系统传染病及中毒型菌痢区别，右上叶累及时可出现颈强直，常被误认为中枢神经系统疾病。急需X线以确定诊断。
3.外科急腹症 部分右下大叶肺炎可刺激膈肌，腹痛和呕吐很明显，并可有腹肌紧张、压痛，需注意与阑尾炎等急腹症鉴别。肺炎时腹部压痛常不局限，腹式呼吸并不减弱。腹部X线、B超检查可助鉴别。有时鉴别时应注意肺炎患儿的腹部压痛不限于右下腹，腹肌痉挛可在轻缓的压力下消失，并无深层压痛。此外，患大叶性肺炎时，体温和白细胞总数一般均较急性阑尾炎更高。
4.支气管结核合并肺段病变 支气管结核合并肺段病变或干酪性肺炎的体征与X线所见，可与大叶肺炎相似，但起病较缓，病程长，病灶吸收慢，上肺居多，并常有结核病密切接触史，结核菌素试验呈强阳性，对青霉素不敏感，而抗结核治疗有效。痰液抗酸染色找到结核杆菌有助于鉴别。
5.肺炎克雷白杆菌肺炎 临床表现与肺炎链球菌肺炎相似，但本病痰呈黏稠脓性、量多带血，典型者呈砖红色胶冻状。X线可有多发性蜂窝状脓肿、叶间隙下坠，痰液检查可发现革兰阴性杆菌，有助鉴别。此外应与其他病原引起的肺炎如肺炎杆菌肺炎、支原体肺炎相鉴别,依赖实验室检查鉴别。
