(一)治疗
1.病因治疗 选用有效抗生素，在没有细菌培养和药敏条件缺乏下，可先用青霉素，红霉素，必要可选用庆大霉素，卡那霉素等。急性期应予抗菌治疗，因AST可有多种病原菌感染，宜采用包括抑制厌氧菌的广谱抗生素。
2.局部处理 病初期局部可冷敷，后期可热敷，同时可外敷中药。
3.外科处理 若脓肿形成应切开引流。甲状腺化脓采用手术切开引流术，一般2～4周可痊愈。病变侵犯一叶，可考虑手术治疗。
急性期后，对证实有LPSF者，必须做瘘管根除术，以防止复发。手术应将瘘管、周围粘连组织及部分受累甲状腺一并切除。也有作者发现切除瘘管内无上皮组织，仅见纤维化或肉芽组织，加之有不少拒绝做瘘管切除的患儿，仍未见复发，提示某些患儿其瘘管有自然愈合可能。鉴于AST经合理治疗不会导致严重后果，因此对瘘管非常细的患儿，可在内科治疗下随访观察而不作切除。
(二)预后
经积极治疗，一般预后良好，但如反复发生AST，反复造成甲状腺坏死，将影响甲状腺功能。