迁延性和慢性腹泻的孩子大多是因为体内缺乏相应的酶所导致的。双糖酶缺乏的孩子，吃含双糖( 包括蔗糖、麦芽糖、乳糖)的食物腹泻加重，大便水样，酸碱度(pH)降低，由于酸性大便刺激，容易发生尿布皮炎。通过测定大便双糖含量可确定诊断。这些孩子可食用不含双糖的饮食，如豆浆奶(即鲜豆浆加10%或 15%葡萄糖)。因人乳和牛乳乳糖含量较高，所以乳糖酶缺乏的孩子不能吃人乳或牛乳。如将人乳或牛乳做成酸乳，乳糖含量下降，可以食用。
乳糜泻的孩子不能吃麦类食物，因各种麦类食物均含麦醇溶蛋白，应该改食动物乳、米类、鸡蛋、瘦肉及豆类食物。
牛乳过敏的孩子最好改吃人乳，因为几乎所有孩子都能耐受人乳，不需顾及人乳过敏问题。牛乳过敏可自然缓解，所以停喂牛乳6个月后，可再试喂牛乳，这样做可判定牛乳过敏状态是否已经消失。