肾积水主要是由二种疾病造成的：
一、输尿管阻塞：这是造成肾脏积水常见的疾病，原因就是输尿管的一小段发生狭窄而引起阻塞，导致肾脏中的尿液不易流至膀胱，停滞在肾脏。通常只要将输尿管狭窄的一段切除，再重新接起来，让输尿管保持通畅，就可以改善肾积水的情形。
二、尿液逆流：在正常的情况下，尿液是从肾脏经由输尿管到达膀胱，然后排出体外;尿液逆流就是尿液从膀胱倒灌回输尿管，甚至回流到肾脏的一种不正常现象。此时，肾脏同时会有准备流到膀胱的尿液，以及从膀胱倒流回来的尿液，这个时候肾脏 的水份就会太多，造成肾积水。