流产必须与功能性子宫出血、输卵管妊娠、葡萄胎、子宫肌瘤、绒毛膜上皮癌等进行鉴别。此外还应鉴别各种类型的流产，以便明确诊断，根据不同类型选择不同的治疗。
1、遗传检查
(1)对疑有遗传性疾病者，夫妇双方均应做染色体核型检查，或进一步做夫妇的家系遗传学调查和系谱绘制。
(2)系谱分析：通过家系调查，分析遗传性疾病对未来妊娠的影响。
(3)核型分析：同时检测夫妇双方外周血淋巴细胞染色体，观察有否数目和结构畸变及畸变的类型，推测其复发概率。
(4)分子遗传学诊断：目前部分基因遗传病可通过分子遗传学检查做出诊断。
2、内分泌诊断
3、免疫学检查
