西医治疗：
消化道隔离。注意适当休息，给予易消化饮食。
1.急性菌痢
(1)一般治疗：高热、腹泻频繁、腹痛剧烈时，应对症治疗。脱水时采用口服补液：葡萄糖20g，氯化钠3.5g，碳酸氢钠2.5g或枸橼酸三钠2.9g，氯化钾1.5g，加温开水至1000m1。脱水明显者给予静脉补液，酸中毒时，应给碱性溶液。
(2)抗菌治疗：根据当时、当地与病人具体情况选择药物。儿童慎用喹诺酮类药。
①诺氟沙星：每次0.4g，每日2次;儿童每日15～20mg/kg，分之次服，5～7日为1疗程。
②依诺沙星，每次0.4g，每日2次;儿童每日15～20mg/kg，分2次服，5～7日为1疗程。
③复方新诺明：每片含SMZ400mg和TMP80mg,每次2片，每日2次，首剂加倍，儿童剂量酌减。5～7日为1疗程。对有磺胺过敏、肝肾功能不全者忌用。用药期间应注意观察血象。
④甲氧苄氨嘧啶(TMP) ：常与磺胺类药物、抗生素或中草药伍用。每次0.1～0.15g，每日2次;儿童每日5～8mg/kg，分2次服， 5～7日为1疗程、用药时要注意观察血象。
⑤抗生素：酌情选用氨基糖甙类抗生素肌肉注射，如丁胺卡那霉素0.2～0.4g，每日2次;庆大霉素8万U，每日2～3次，其次为氨苄青霉素4～8g/天，静脉滴注;磷霉素钠2～6g/天，静脉滴注。亦可用环丙沙星0.2g，每日2次，静脉滴注。
⑥短程快速疗法：诺氟沙星0.6g或黄连素1g (或土霉素1 .5，加TMP 0.2g，每12小时1次，4次为1疗程。高热时酌加泼尼松10～20mg，腹痛者酌加山莨菪碱(654-2)10～20mg。
2.中毒性菌痢
(1)解除血管痉挛：疾病早期即给予血管扩张药，以解除血管痉挛，可用山莨菪碱(654-2)或阿托品治疗。654-2剂量为每次40mg，儿童每次1～2mg/kg，每10～15分钟静注1次。病情危重时剂量加大，每次50～60mg，儿童每次 3～4mg/kg。待四肢转暖，面色微红，呼吸及循环改善时停药。也可用阿托品，每次0.03～0. 05mg/kg，用法同654-2。
(2)降温止惊：高热易致惊厥，加重脑缺氧和脑水肿，采用物理方法降温，同时用1%温盐水1000m1流动灌肠，并酌用适当退热剂。对极度躁动不安者用安定10mg肌肉注射或静脉注射;或水合氯醛40～60mg/kg灌肠;或苯巴比妥钠5mg/kg肌肉注射。
(3)防治循环衰竭
①扩充血容量，纠正酸中毒，维持水和电解质平衡：对无明显水与电解质平衡失调者，按生理需要量补充，成人每日2500～3000m1;儿童每日 80～100ml/kg，分批静脉滴注。开始2～3批用1/2等渗液体，尔后用1/3等渗液体。对吐泻严重、有明显酸中毒及循环衰竭时，先用5%碳酸氢钠液，成人每次250～300m1，儿童每次5ml/kg、静脉快速滴入或静脉推注。后用2：1溶液(2份生理盐水，1份1.4%碳酸氢钠溶液)成人每次 500m1，儿童每次10～20ml/kg，静脉点滴。尔后用6%低分子右旋糖酐，成人每次不超过500m1，儿童按10～20ml/kg(一次最大量不超过300ml)静脉滴入。待有小便、酸中毒纠正及循环改善时，改用生理维持液补给。低钾者须补钾。根据病情掌握液体总量及速度。
②应用血管扩张药：对循环衰竭患者在扩容纠酸的基础上或与扩容纠酸的同时，根据病情需要给予血管扩张药以改善微循环。常用654-2，用药方法同上。
③激素治疗：早期应用激素可较快地缓解高热和感染中毒症状，防止病情加重。常用泼尼龙(氢化可的松)或地塞米松。泼尼龙的用量成人每日300～400mg，儿童每日5～10mg/kg，分3～4次，加入葡萄糖液或生理盐水中静脉滴注。地塞米松剂量为0.5～1.0mg/kg，加入输液瓶莫菲氏滴管内静脉滴注，必要时6小时后可重复使用。
④毛地黄制剂的应用：心功能不全者，可用毛花甙丙或毒毛旋花子甙K治疗。
⑤缩血管药的应用：休克早期应用缩血管药可加重微循环障碍，减少组织的灌注量，弊多利少。经扩容纠酸、应用血管扩张药、强心、激素治疗等综合措施后，休克症状并无明显的好转或反趋恶化时，可加用升压药如间羟胺或多巴胺。
(4)防治脑水肿及呼吸衰竭。
①应用大剂量山莨菪碱治疗(用法同上)。、
②应用脱水剂治疗：有脑水肿表现时，立即用20%甘露醇或25%山梨醇每次1.0g/kg，静脉注射，4～6小时1次，与50%葡萄糖交替应用。必要时可用30%尿素每次0.5～1.0g/kg，静脉推注，直至脑水肿症状消失。
③其他：输液、给氧。吸痰、保持呼吸道通畅、如呼吸停止，立即插管或气管切开，用人工呼吸器。
(5) 抗菌治疗：近年来耐药菌株逐渐增多，为有效地控制感染，应联合使用两种抗菌药物。可采用氨苄青霉素和庆大霉素静脉点滴或肌肉注射，剂量同前。待能口服或中毒症状好转后，按急性菌痢治疗。
(6) 视伴发病和并发症的治疗。
3. 慢性菌痢
(1)生活规律，注意体质的增强：慢性菌痢患者的生活起居要有规律性，除急性发作型外，均可适当地参加些轻度体育活动，如广播体操、太极拳及气功等、这对增强体质、恢复体力有一定帮助。对于食欲差、长期腹泻、消化吸收不良者，注意补充维生素B、C等。
(2)合理应用抗菌药物：粪便细菌培养阳性者作药敏试验，选用敏感药物治疗。粪便培养阴性者，采用既往未用过的抗菌药物，或根据该地区耐药菌株的情况，采用较有效的药物。最好应用两种抗菌药物进行治疗，疗程延长到10～14天。有时可反复多个疗程，直至症状消失，细菌检查转阴为止。但切忌过多滥用抗菌药物，否则易致耐药菌株的增加和肠道菌群失调。
(3)治疗肠粘膜病变：对肠粘膜有病变者，可用2%磺胺嘧啶银胶悬液或0.3%黄连素液保留灌肠治疗。每次用量为200m1，每晚保留灌肠1次，14～21天为1疗程。
(4)肠功能紊乱的治疗：长期应用抗生素治疗的患者，易发生肠道功能紊乱，表现便次增多，但粪便涂片镜检无明显异常，可用乳酶生、乳酸菌素或双歧杆菌制剂等治疗。
(5)其他治疗：免疫功能异常者，酌用免疫调整剂。对并发症或伴发病如肠寄生虫病(蛔虫、钩虫)、贫血或其他疾病等，均应给予相应的治疗。
中医治疗：(1)湿热痢：治法：清热化湿解毒，辅以调气行血。
方药：初起用芍药汤加减。方用黄连、黄芩清热化湿解毒;当归、芍药、甘草行血和营;木香、槟榔行气导滞;大黄泻实热。兼有恶寒发热、头痛等表证者，加葛根、连翘、荆芥等。挟食滞者，加六曲、山楂。
如热重下痢，赤多白少，或纯赤痢，发热较高，口渴引饮，舌红苔黄，脉滑数者可用白头翁汤清热解毒，酌加银花、芍药、枳实、甘草等。
(2)疫毒痢：治法：清热凉血解毒。
方药：白头翁汤加减。方用白头翁凉血解毒;黄连，黄柏、秦皮苦寒化湿清热。可加银花、黄芩、赤芍、丹皮等清热凉血。如高热神昏抽搐，可服紫雪丹以清营熄风。
如面色苍白，四肢厥冷，汗多，喘促，脉细弱者，是正虚邪陷、内闭外脱之证，可急服参附汤或生脉散治疗。脱证解除后、仍按原证治疗。
在疫毒痢和湿热痢过程中，若出现饮食不进、恶心呕吐、精神疲乏证候，称“噤口痢”，是由于湿热疫毒蕴结肠中，上攻于胃，胃失和降，运化无权所致。可用开噤散加减。方用黄连、石富菖、茯苓、陈皮、半夏、荷叶蒂、大黄等煎水少量多次徐徐咽下，以解毒降逆。如胃之气阴耗伤较甚者，可酌加人参、麦冬、石斛、沙参等，以和胃养津。如“噤口”症状解除，仍可按疫毒痢或湿热痢进行治疗。
(3)阴虚痢：治法：坚阴泄热，扶正止痢。
方药：黄连阿胶汤合驻车丸去干姜。方中阿胶、黄连、黄芩，坚阴止痢;芍药、当归和血止痛;加瓜蒌润肠而泻利气机。本证不宜攻，免伤真阴。可取酸甘化阴法或从养精气治。
(4)休息痢：治法：健脾益气，清化湿热。发作时以清化湿热为主，休止时以健脾益气为主。
方药：发作时可用芍药汤或白头翁汤加减。休止时可用健脾和胃汤合香连丸。
(5)虚寒痢：治法：温补脾肾，佐以固脱。
方药：桃花汤合养脏汤加减。方用党参、白术益气健脾;干姜温中散寒;肉桂、肉豆蔻温肾止泻;木香调气理脾;当归、白芍和血止痛;诃子、赤石脂、罂粟壳涩肠止泻固脱;梗米养胃和中;炙甘草和中。
中药治疗：马齿苋、苦参、铁苋菜、地锦草等对细菌性痢疾均有一定疗效。
针灸治疗：
主穴：天枢、止泻或关元，足三里或上巨墟。配穴：发热配曲池、合谷;上腹痛配中脘;呕吐配内关;里急后重配阴陵泉。每天：1～2次，5～6天为1疗程。
中西医结合治疗：
急性菌痢用抗菌药或单纯服用汤药均可治愈。中毒性菌痢多见于儿童，且惊厥、昏迷等症状常出现在腹痛下痢之前，病情险恶，宜中西医结合进行抢救。慢性菌痢病程长，反复发作或迁延不愈，除用抗菌药控制急性症状外，按中医分型辨证施治用汤药治疗，同时可加用针刺治疗以调整肠道功能紊乱。诊治参考：
1.急性菌痢的治疗，短程快速(2日)疗法：先后采用土霉素+TMP、黄连素+TMP、吡派酸+TMP、诺氟沙星+TMP等，单一疗程治愈率可达95%以上。中医以清热解毒利湿为主，辅以调气行血。初期用芍药汤加减，湿热并重者用白头翁汤加减。
2.中毒性菌痢发病急骤，病情险恶，宜中西医结合治疗。应用血管扩张药以解除血管痉挛，补充血容量，纠正酸中毒防治循环衰竭。应用脱水剂防治脑水肿及呼吸衰竭。中医的治疗是清热解毒凉血，应用白头翁汤加减。对出现休克者，急服参附汤或生脉散治疗。
3.慢性菌痢病程长，反复发作或迁延不愈，除重视一般治疗外，合理应用抗菌药物。对阴虚痢的治疗是坚阴泄热，扶正止痢。用黄连阿胶汤合驻车丸加减。休息痢发作时以清化湿热为主，可用白头翁汤加减。休止时以健脾益气为主，可用健脾和胃汤合香连丸。对虚寒痢应温补脾肾，佐以固脱。用桃花汤合养脏汤加减。
疗效评定标准：
1.急性与中毒性菌痢
(1)近期治愈：①症状消失。②每日大便不超过两次，且外观正常。③粪便镜检：停药后隔日检查1次，连续两次，查10个高倍视野，每视野白细胞数均不超过 3个。④粪便培养或荧光抗体检查：停药后隔日1次，连续两次阴性。如无条件做此两项检查，应达到①②③项，并在停药后观察4日无改变。
(2)治愈：出院后每月随访1次，内容包括症状、体征、粪便检查及细菌培养，经6次随访，各项均为阴性。
2.慢性菌痢
(1)近期治愈：除达到急性菌痢的近愈标准外，肠镜检查结果正常。设备条件不足的单位，在患者达到急性菌痢近愈标准的前3项后，须停药观察8天。各项检查均无改变，始可出院。
(2)治愈：同急性菌痢。
预后： 本病一般只要治疗得当，多在1～2周内痊愈。若急性菌痢处理不当，易致慢性菌痢。慢性期患者常并发营养不良、贫血和各种维生素缺乏症。一般预后良好，大多在短期内治愈。急性菌痢如治疗不当可转为慢性菌痢。中毒性菌痢如未能及时诊治或并有严重伴发病和并发症者，则预后不良。
