与心脏黏液瘤、心肌纤维瘤、心脏血管瘤等疾病鉴别。
1.心脏黏液瘤 为心脏原发良性肿瘤中最常见者，80%发生于左心房，亦可见右心房、左心室等处。女性发病略多，瘤体多呈单个，息肉状、球状或分叶状。软而脆，表面光滑，大小从樱桃至蜜桃不等。时有长短不一的瘤蒂，蒂长者有活动度，可阻塞血流引起症状。表面部分大小不等的碎片容易脱落而引起栓塞。二维B超及磁共振等影像学检查，除对肿物的形态特征作出判断外，对于黏液瘤的组织学特性也常能作出初步判断。
2.心肌纤维瘤 多在室间隔或心室壁呈单个发生。瘤体坚硬呈非包被团块，一般直径3～7cm。多数纤维瘤侵犯传导组织，患者多突然死于心律失常。患者不伴有结节性硬化(精神发育不全、惊厥、语言缺陷)，可资鉴别。
3.心脏血管瘤 为罕见心脏肿瘤，表现为心脏结构受压或流出道阻塞所致症状。CT增强扫描或MRI可确定这种高度血管化肿瘤的诊断。