(一)发病原因

阴道上皮内瘤样变的病因至今仍未明了。目前认为HPV感染是发生VAIN最主要的因素。其他可能的病因为宫颈癌或外阴癌曾行放射治疗和免疫抑制剂治疗，也有人认为绝经后萎缩的上皮更易发展成VAIN。

(二)发病机制

阴道病灶黏膜可呈正常、糜烂或稍为隆起增厚的白斑。阴道镜下观察，病灶扁平或稍隆起，可伴有点状或镶嵌状改变。碘试验阳性。

镜下表皮层细胞可部分或全部分层不清、排列失去极向和出现异形细胞核。按表皮层细胞病变的范围分为：病变局限在上皮1/3为Ⅰ级(轻度不典型增生)、中下2/3为Ⅱ级(中度不典型增生)、超过2/3或全层为Ⅲ级(重度不典型增生/原位癌)。