鉴于胰腺异位发生的部位、大小、数量、病理及继发病变各异，其所产生的临床症状较为多变，而又无特征性可言。多数可以没有任何临床表现，也可以出现所在器官不同的梗阻、出血、肿瘤的症状。因而有人按其症状归纳为6类。
1.梗阻型 由于胰腺异位为一种肿瘤样病变，可引起所在器官的压迫或狭窄而出现梗阻症状。如位于胃窦部可引起幽门梗阻;位于十二指肠乳头可引起胆道梗阻。
2.消化道出血型 Nelson报告胰腺异位引起消化道出血占8.57%，其原因系胰腺异位周围胃肠道黏膜充血、溃烂，以至形成溃疡，或侵蚀胃肠道黏膜血管。
3.溃疡型 位于幽门前区的胰腺异位，由于分泌胰蛋白酶，消化黏膜而形成溃疡;或位于黏膜下的胰腺异位压迫上层黏膜引起黏膜萎缩而形成溃疡。
4.肿瘤型 由于胰腺异位多位于黏膜下或肌层内，使局部隆起，在钡餐检查时易误为肿瘤。
5.憩室型 胰腺异位常发生在憩室内。
6.隐匿型 胰腺异位是一种先天发育异常，往往到中青年才出现症状，有的终身无症状，仅在尸解中发现有胰腺异位。
在临床工作中，遇到消化道梗阻、出血、溃疡、憩室及隆突性病变的患者，应想到胰腺异位的可能，本病主要在手术或尸检中被偶尔发现。近年来，由于影像学和内镜的广泛开展，有些部位的胰腺异位可通过胃肠造影、内镜超声和纤维内镜的检查，得到明确的诊断。