如果角膜发生匐行性改变,有真菌性角巩膜炎的临床表现,真菌培养和巩膜或角巩膜活检阴性,对广谱抗生素治疗无效,真菌可通过完整的Descemet膜侵入前房,引起前房积脓,角膜尚未穿孔时行前房穿刺,立即用血琼脂或SDA、或BHI室温培养,以确定真菌。但前房穿刺时的创口可能将细菌等微生物接种于前房,必须慎重。
若首先临床疑诊真菌感染,但染色或培养(48h)阴性,早期广谱抗微生物治疗无效,则需作巩膜或角巩膜小片状病灶组织切除活检。可在手术显微镜下切除包括结膜或角巩膜、表层巩膜和筋膜囊病灶组织。一半送往微生物实验室,将组织碎片放入1ml肉汤中混匀,一滴样本用不同的培养基包括在室温下的血琼脂、SDA、BHI单独培养真菌;另一半浸入甲醛送往病理实验室用PAS、GMS、CFW特殊染色,以确定真菌。