1.非手术治疗
大部分患者需要手术干预治疗，仅少数患者可以非手术治疗。非手术治疗的适应证包括：因严重的原发病或其他伴随疾病不能耐受手术者;同时伴有内脏栓塞频繁的临危状态者;腘动脉以下的小动脉栓塞并有良好侧支循环者。
(1)一般治疗 患者绝对卧床取头高脚低位使下肢低于心脏平面同时密切观察患侧肢体皮肤颜色、皮肤温度、脉搏波动的变化情况以及生命体征。
(2)溶栓治疗 当较小血管栓塞或栓塞部位位于不容易接近的地方或患者的全身状态不允许手术，并且无溶栓禁忌证者应尽快采用溶栓治疗溶栓治疗一般对发生于3天以内的新鲜血栓效果好，而超过7天者效果差;采用区域性动脉导管滴注比全身用药效果好关于溶栓药物的使用各家采取的剂量、方法有所差异。
(3)抗凝治疗 急性动脉栓塞抗凝治疗的目的是防止血栓延伸和继发性血栓形成(包括继发性深静脉血栓形成)住院患者应该立即使用抗凝剂肝素。
(4)经皮腔内血管成形术(PTA) PTA治疗对于动脉局部病变引起的急性动脉闭塞效果良好。单纯PTA的缺点是复发率高随着血管支架的使用复发率明显减少。对大血管的治疗效果比小血管好。PTA治疗后要继续抗凝治疗。
(5)其他用药 ①右旋糖酐40(低分子右旋糖酐)：可以扩容、降低血黏度防止血栓形成。用法：250～500ml/d静脉滴注共7天。②解痉止痛及血管扩张剂：如山莨菪碱、阿托品;吗啡类;酚妥拉明、妥拉唑林、罂粟碱等。③基因治疗：研究最多的是血管内皮生长因子和成纤维细胞生长因子。利用重组蛋白和基因转导方法将蛋白和基因导入机体细胞使之在缺血缺氧区域表达VEGF或FGF，刺激血管再生。临床试验已经证明对肢体动脉栓塞患者采用基因转导和腺病毒转染方法进行血管再生治疗，取得了令人鼓舞的效果。
2.手术治疗
大多数血栓栓塞患者需要手术治疗。手术分为动脉切开取栓术和Fogarty球囊导管取栓术。而后者因其操作简便、手术条件要求相对较低手术创伤范围小现已经广泛使用并取代了动脉切开取栓术对于大动脉的栓塞，尤其是主动脉分叉处鞍形血栓，动脉切开取栓术仍是最有效的方法。对于肢体其他动脉的栓塞可选用Fogarty球囊导管取栓术。
另外在保守治疗中一旦患者出现病情恶化应该立即手术治疗其效果决定于手术治疗的时间若手术失败并发坏疽，则应行截肢处理。