在治疗时，许多医生都会要求患者接受综合性的治疗，其中药物治疗是综合性治疗的重要一个治疗步骤。治疗尖锐湿疣主要是包括物理治疗方式以及外用药治疗，而物理治疗主要是激光手术等明显伤害皮肤的治疗方式，尔尔外用药治疗包括有西药和中药外用药物治疗。
目前关于治疗尖锐湿疣的方法有许多，但最为简便且安全、治疗效果好的方法是重要外用药物综合治疗。 许多患者在接受外用药物治疗自己的尖锐湿疣会感觉效果明显好转，这是为什么呢?
事实上，一般用来去除疣体的外用药物，主要分为含有腐蚀性成份的西药制剂和不含腐蚀性成份的中药制剂两种。而含有腐蚀性成份的药物，一般通过对局部疣体组织的腐蚀，从而促使疣体自身发生溶解、溃烂，进而疣组织出现坏死，从而脱落达到去除疣体的目的而促使疾病痊愈，但这种药物通常可以伤及真皮组织，容易造成疤痕，影响患者皮肤外观。而不含腐蚀成份的外用药，一般通过抑制病毒所寄生的细胞对外界氧的摄取，促使带有病毒的细胞因摄氧不足而死亡、最后脱落，在疣体脱落的同时，病毒细胞也随之离开人体皮肤，没有腐蚀性，不伤害真皮层，因而不会留下疤痕。因此这就是为什么说外用药来治疗尖锐湿疣明显效果较好，也吸引不少患者的选择对象。
由于许多人对尖锐湿疹这种疾病的不认识，因此促使许多患者多这种疾病产生恐惧、忧虑以及精神负担过重，长期背负沉重的心理负担会可扰乱机体正常免疫功能，降低机体免疫功能和抗病毒能力，给病毒繁殖提供一个机会，因而也成为尖锐湿疣复发、治疗困难的原因。在治疗时，就需要首先消除尖锐湿疣的患者的恐惧心理。