阴茎根部寻常疣是一种由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的皮肤疾病，具有传染性。对于这种情况，建议及时到正规医院的皮肤性病科进行诊断和治疗。治疗方法主要包括物理治疗和药物治疗。
物理治疗方面，激光治疗是首选方法之一。通过局部常规消毒后，使用2%的利多卡因进行局部麻醉，然后用二氧化碳激光将疣体逐个烧除。此外，冷冻治疗也是一种常用的物理疗法，利用零下196℃的液态氮气将疣体组织冻死，从而达到治疗目的。这些物理治疗方法通常效果较快，但可能会留下轻重不一的疤痕。
药物治疗方面，可以辅助使用一些抗病毒药物和外用药膏来防止复发。例如，咪喹莫特乳膏、干扰素凝胶等都是常用的抗病毒药物。同时，还可以使用抗生素类外用药来防止感染并促进愈合。需要注意的是，药物治疗的效果可能相对较慢，且需要持续使用一段时间才能看到明显效果。
除了上述治疗方法外，提高自身免疫力也是预防和治疗寻常疣的重要措施。可以通过多做体育活动、保持规律饮食和作息、避免发生不洁和高危的性行为等方式来有效提高自身免疫力。
对于阴茎根部寻常疣的治疗，应根据具体情况选择合适的治疗方法，并在医生的指导下进行规范治疗。同时，注意个人卫生和提高免疫力也是预防和治疗寻常疣的重要措施。