早期：甲亢期。程度轻时病人仅有轻度的甲亢症状，如食欲好、容易累、轻度失眠、烦闷急躁等。程度重时，则会出现明显的甲亢症状，稍服治甲亢的药即可获良好效果，但也容易出现药物性甲低。也有的患者因炎症的减轻，不治而“自愈”。疗效好，复发率高是本阶段的特点。中期：甲亢甲低并存期。甲状腺组织经多次、反复的破坏，有正常功能的细胞逐渐减少，减到一定程度就出现甲低症状了。这时期还有一个特点，患者有甲亢症状，但化验指标会稍高或正常。晚期：甲低期。分泌的甲状腺素更加减少，临床上已是甲低表现了。所以，本期患者补充甲状腺素后，化验指标虽然正常，很多人却时时感觉不舒适，有时还会感觉有甲亢症状。值得注意的是，也有一部分患者因感染的加重出现甲亢指标和甲亢症状，有些着述称之为“甲低转甲亢”。临床上，慢性甲状腺炎患者的每一次甲亢的出现，都预示着甲低的进一步加重。综上所述，可见在慢性甲状腺炎的发展过程中，早期并非没有特殊感觉，只是这些感觉没有被患者重视，未去就医。就医的，也因化验结果不支持患者的陈述，被医生忽略。中晚期，指标低的极易诊断，而指标正常和高的则极易误诊。指标正常，无法判断，医生让回家观察，过一段时间再化验。指标高
本病发展缓慢，可以维持多年不变，如不予治疗，除少数病例自行缓解外，最终均发展成甲状腺功能减退。其自然发生粘液性水肿的过程约为10年左右，应予及时治疗。其治疗原则是无限期的甲状腺激素替代疗法。干制甲状腺片从30mg开始，间隔7～10天增加20mg，总量为120～180mg/d，3～6个月后腺体缩小，症状减轻，以后给维持量60～90mg/d。应用类固醇药物可使甲状腺缩小，硬度减轻，甲状腺抗体效价下降，一般用强的松30～40mg／d，1个月后减量到5～10mg/d，常与甲状腺制剂合用，随访观察，并调整用量。一般不采用手术治疗，因可使之发生甲状腺功能减退的可能。但有下列情况可考虑手术治疗：①口服甲状腺制剂后甲状腺不缩小，仍有压迫症状，可作甲状腺部分或峡部切除;②疑有甲状腺癌或其他恶性肿瘤时，可手术活检。若无恶性病变，即终止手术。术后一律用甲状腺制剂以防甲减或复发。
中医传统医籍里统称甲状腺疾病为“瘿病”，认为这类疾病的发生，由于人体饮食失节、情志内伤等，造成阴阳失调、气血失平，气滞、血瘀、痰凝于颈项，形成甲状腺肿大，并出现相关的临床症状，这其中包括有“气瘿(结节性甲状腺肿)、肉瘿(甲状腺瘤)、石瘿(甲状腺癌)等，虽然在中医传统着作里没有桥本氏病的具体名称，但在有关其它甲状腺疾病的治疗中，叙述了不少这种疾病的临床治验。现代中医学认为，桥本氏病的中医特点是虚实夹杂，病之根本是正气内虚，而外有瘿肿，结合西医免疫学观点，因此属难治之病。治疗上可根据病人的具体情况，分别采取标本兼治之法，补益正气、疏肝解郁、活血化痰、消瘿散结，达到提高自身免疫能力，缓解不适症状和消除肿大的甲状腺的目的，此外还可以配合甲状腺局部外用化瘀散结的软膏，以提高治疗效果。
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