胚胎移植46天拉肚子是不正常的，原因可能有以下几点：
1. 饮食问题。胚胎移植后，由于饮食改变和运动量减少，容易导致消化不良和腹泻。这种情况下，腹泻通常不会持续太久，也不会太严重。
2. 着床反应。在胚胎着床期间，部分人可能会出现一些不适症状，如轻微腹泻等。但这种症状通常只会持续很短时间。
3. 疾病因素。如果腹泻持续时间较长，且伴有其他不适症状，如发热、腹痛等，可能存在疾病因素，如肠胃炎等。这种情况下，建议及时就医。
总之，胚胎移植46天拉肚子是不正常的，可能由多种原因引起。如果出现持续或加重的症状，建议及时就医，以便及时得到治疗。