一年后跖骨骨折疼痛可能有以下原因：
1. 骨折处存在开放性伤口。
2. 骨折处因为经常负重活动，出现了创伤性关节炎。
3. 骨折处由于长时间不活动，出现了肌肉的废用性萎缩。
4. 骨折复位不好，关节融合。
5. 骨折处有大量的骨痂生成，形成了明显的骨痂连接。
6. 骨折处有不全骨折或者是嵌插骨折。
7. 骨折治愈后不正确的运动训练。
8. 患处关节出现炎症。
9. 患处出现创伤性关节炎。
10. 患处出现肌肉萎缩。
11. 患处关节粘连。
12. 局部的疼痛麻木。
13. 局部的神经受损。
14. 局部的血管狭窄。
15. 局部的韧带粘连或钙化。
以上是骨折治愈后可能出现的情况，具体症状表现存在个体差异，需要及时完善相关检查，如核磁共振等，明确诊断后积极治疗。