痘痘好了后留下痘坑的原因可能有以下几个：
1. 炎症造成的损伤：痘痘在皮肤内部形成时，会引起炎症反应，破坏周围的组织，导致皮肤产生凹陷或疤痕。
2. 治疗不当：如果痘痘在治疗过程中没有得到有效的控制，或者使用了不合适的治疗方法，可能会导致痘痘留下疤痕或凹陷。
3. 自身免疫力不足：一些人的皮肤自身免疫力较差，容易在痘痘形成后留下疤痕或凹陷。
4. 遗传因素：有些人天生就容易留下痘坑，这可能与遗传有关。
5. 暴力挤压痘痘：挤压痘痘会破坏皮肤组织，导致痘痘留下疤痕或凹陷。
总之，痘痘好了后留下痘坑的原因可能是多种多样的，需要根据个人情况进行综合分析。为了避免留下痘坑，应该在治疗痘痘时尽可能避免使用暴力挤压的方法，选择合适的治疗方法，并保持良好的皮肤护理习惯。