强直性脊柱炎头骨可能会疼痛，原因如下：
1. 颈椎受累：强直性脊柱炎会导致颈椎关节炎症，使颈椎受到压迫和疼痛，进而引起头痛。
2. 眼部炎症：强直性脊柱炎患者可能会出现眼部炎症，如著名的“强直性脊柱炎眼炎”，这种情况下眼睛周围的头部区域可能会出现疼痛。
3. 颅底关节炎：颅底关节是头骨和颈椎之间的关节，如果这个关节受到炎症的影响，就会引起头痛。
4. 神经根受压：强直性脊柱炎可能会导致神经根受到压迫，这种情况下头痛可能会伴随着颈部疼痛和手臂麻木等症状。
总之，强直性脊柱炎患者头骨疼痛的原因可能是多方面的，需要根据具体情况进行诊断和治疗。