血栓性闭塞性脉管炎与高血压、高血脂、糖尿病等传统的心血管疾病因素无关。其病因主要与免疫系统异常有关,可能是由于自身免疫反应、感染、药物、化学物质等因素引起的免疫系统异常导致血管内膜炎症反应,进而引发血管内膜增厚、血栓形成和血管闭塞等病理变化。此外,血栓性闭塞性脉管炎也与遗传因素有关,有家族性倾向。