一般不外乎以下几种情况。
●生理性哭闹 孩子的尿布湿了或者裹得太紧、饥饿、口渴、室内温度不合适、被褥太厚等，都会使小儿感觉不舒服而哭闹。对于这种情况，父母只要及时消除不良刺激，孩子很快就会安静入睡。此外，有的孩子每到夜间要睡觉时就会哭闹不止，这时父母若能耐心哄其睡觉，孩子很快就会安然入睡。
●环境不适应 有些孩子对自然环境不适应，黑夜白天颠倒。父母白天上班他睡觉，父母晚上休息他“工作”。若将孩子抱起和他玩，哭闹即止。对于这类孩子，可用些镇静剂把休息睡眠时间调整过来，必要时需请儿童保健医生作些指导。
●白天运动不足 有的孩子白天运动不足，夜间不肯入睡，哭闹不止。这些孩子白天应增加活动量，孩子累了，晚上就能安静入睡。
●午睡时间安排不当 有的孩子早晨起不来，到了午后2~3点才睡午觉，或者午睡时间过早，以至晚上提前入睡，半夜睡醒，没有人陪着玩就哭闹。这些孩子早晨可以早些唤醒，午睡时间作适当调整，使孩子晚上有了睡意，就能安安稳稳地睡到天明。
●疾病影响 某些疾病也会影响孩子夜间的睡眠，对此，要从原发疾病入手，积极防治。
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对于你家的两岁宝宝咳嗽很厉害，晚上睡不好，怎么办?的问题，我觉得你也不比过于担心，放轻松。
多喝水，无论孩子有什么病多喝水准没错。母亲不要吃太油腻和凉的东西。宝宝的抵抗力很差，我觉着应该是她还没有好利索的时候，你们就停止给她看了吧。一般好的之后几天也要继续服药。咳嗽时间长了，在气管里就会有浓痰，他们还小不会向大人一样吐出来，所以会好的很慢。
希望我关于两岁宝宝咳嗽很厉害，晚上睡不好，怎么办的回答能给你带来帮助！！！
宝宝睡觉不踏实、哭闹的原因和对策1.缺微量元素，血钙降低引起大脑及植物性神经兴奋性增设导致宝宝晚上睡不安稳，需要补充钙和维生素D，2.太热、太冷 3.、积食、消化不良，上火或者晚上吃的太饱也会导致睡眠不安。建议喂粥、面等固体食物应在临睡前至少两三小时喂，睡前再喝一点奶。4.宝宝哭闹，不要及时做出反应，等待几分钟，因为多数小孩夜间醒来几分钟后又会自然入睡
以上是对“5个月的宝宝肠道功能混乱晚上睡不好怎么办”这个问题的建议，希望对您有帮助，祝您健康！