生殖疱疹的并发症有神经系统病变、留下疤痕、增加心理负担、引起其他性疾病，需要及时采用正确的方式治疗，比如无菌生理盐水局部清洗、使用抗病毒类药物。发病期间也要避免性生活，否则会交叉感染，让治疗病程增长。
1、神经系统病变
生殖疱疹病毒会沿着周围神经对三叉神经节造成侵犯，再长时间潜伏于神经细胞当中。当机体受到过敏、发热、损伤等因素的影响会复发，并引起脊髓炎、腰髓部神经炎等疾病，会出现膀胱麻痹、下肢放射性疼痛等症状。
2、留下疤痕
生殖疱疹发作期间，生殖器及周围皮肤会出现血泡或者水泡，恢复以后会形成大量疤痕，对皮肤美观造成的影响比较大。
3、增加心理负担
生殖疱疹可能会反复发作，从而增加患者的心理负担，情况严重还会引起心理障碍，害怕传染给其他人，而且不愿意和他人过多交流，这样就会对心理健康造成严重影响。
4、引发其他性疾病
生殖疱疹可能会为艾滋病毒的侵入提供渠道，这样患艾滋病的风险就会提高。所以出现生殖疱疹后要及时检查，再根据医生指导正确治疗。
