小孩传染性软疣可自行消退，可不必接受特殊处理，如果疣体数量较多，伴有剧烈瘙痒、疼痛等症状，则需要及时接受治疗，治疗方法主要有药物治疗、手术治疗、物理治疗及中医调理等，需采取综合治疗的方法，以促进疣体消退，避免再次发作，以下是具体介绍。
1.药物治疗。能够去除传染性软疣的药物主要有水杨酸制剂、咪喹莫特霜剂等，其中水杨酸制剂是重要的药物，能够加速疣体消退，与聚维酮碘溶液联合使用，治疗效果会更好。如果伴有免疫抑制的问题，可使用咪喹莫特霜剂。患儿还可以服用中药进行调理，比如治疣汤，治疣汤的组成包括红花、熟地、桃仁、白术、川芎等，可有效促进皮损消退。
2.手术治疗。治疗该病的手术方式主要是夹除术，需要用到特制的镊子，对皮肤常规消毒后，直接用镊子夹除掉，将内容物挤出，然后涂抹碘酊避免发生感染。患儿也可接受切除术，适合疣体较深的情况，但是创伤比较大，术后容易留下瘢痕。
3.物理治疗。小孩传染性软疣可采取物理治疗，比如冷冻治疗、电灼治疗、激光治疗等方式，其中冷冻治疗利用的是液体氮，将其喷在疣体表面，能够使疣体逐渐脱落，适合怕疼的患儿，而电灼治疗具有安全、简单的特点，通过对各个疣体进行点刺烧灼，然后用碘酒进行消毒处理，治疗效果明显。
以上是小孩传染性软疣的具体治疗方法，临床上以药物治疗为主。在很多情况下，软疣可以自然消退，不少患儿可在一年内消退，绝大部分在五年内消退，虽然容易复发，但恶变的可能性非常低，不必过分担心。要降低复发的风险，平时要注意个人卫生，不得与他人共用私人用品，尽量少去公共游泳池。