男非淋菌性尿道炎一般可以治好，而治疗的方法主要是抗生素药物，例如大环内酯类、喹诺酮类、四环素类等。
1.大环内酯类：大环内酯类抗生素对于一些非典型致病菌、大多数革兰氏阳性菌以及部分革兰氏阴性菌都有效，常用的有阿奇霉素片、罗红霉素片等。不过要注意的是，部分患者用药之后，可能会出现中上腹痛、食欲下降、腹泻、呕吐、恶心等不良反应，建议患病者严格按照医生指导谨慎使用。此外，孕妇以及哺乳期妇女需慎用，此类药物过敏者需禁用。
2.喹诺酮类：喹诺酮类抗生素具有抗菌能力强、抗菌谱广、不良反应较少等优点，常用的药物是环丙沙星片、左氧氟沙星片等，但患病者也需根据医生指导使用。
3.四环素类：四环素类抗生素属于广谱抗生素，也可以抑制患者炎症，帮助改善患者病情，常用的是多西环素片、四环素片等，但服用者可能会出现上腹不适、呕吐、恶心、腹泻等不良反应。
男非淋菌性尿道炎患病者在病情未治愈期间，需尽量避免性行为，同时注意个人卫生，勤换洗内裤。