生殖器疱疹通常可以擦碘伏消毒，但是对生殖器疱疹没有治疗作用。
生殖器疱疹通常是由于单纯疱疹病毒感染导致，一般会通过皮肤黏膜、呼吸道等传播，通常会出现在尿道、宫颈、外阴皮肤等部位。通常生殖器会出现溃疡、糜烂和水疱等症状，患者还会出现头痛、全身无力、发烧的症状，表现为便秘、肛周溃疡和局部疼痛。碘伏通常可以用于皮肤、黏膜消毒，碘伏的效果确切患者容易接受，使用碘伏时通常不会出现疼痛，碘伏可以杀灭细菌和真菌，碘伏一般只可以外用。所以生殖器疱疹可以擦碘伏消毒，但是没有治疗的作用。
生殖器疱疹初期可以在医生指导下，使用阿昔洛韦片、盐酸伐昔洛韦片等药物治疗，如果生殖器疱疹反复发作，患者通常需要长期服用药物治疗。生殖器疱疹如果出现疼痛的症状，在医生指导下使用阿司匹林片、对乙酰氨基酚口腔崩解片，患者也可以外用阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏进行局部治疗。
患者平时需要用温水清洗患处，避免饮酒、浓茶、浓咖啡，平时可以穿纯棉吸收性好的内裤，适当进行休息避免熬夜。