患艾滋病治疗的过程中要检测药物的副作用，主要是对肝肾，血浆乳酸，等方面的检查，必要的情况下才会进行药物调整。目前所推的治疗方法，是由全球几位知名的艾滋病治疗专家，共同推出的抗病毒治疗。
患艾滋病的患者应该明白，目前治疗方法上没有满意的，都只能采取稳定治疗，主要的药物当中以主要是包括以下几个，第一个方面是抗hiv药物叠氮胸苷，这个主要作用是用于hiv的复制，同时这个药已经能进行工厂都上的生产，但国内并没有进行工厂相应的生产，这个药在国内主要是以进口，由美国食品及药物管理局首先批准用于临床，它能够提高患者的免疫能力，减缓了疾病的进程，延长患者的存活时间，并且减少了一些感染疾病的几率，降低了死亡率，但同时也要注意，这个药物也是有一定副作用的，它抑制了一些细胞的生长。其主要抑制的是骨髓全身血细胞，血细胞的减少将会继发感染加重，同时可能会引起药物发热，等一些反应。
第二种药物是双脱氧药物，也就是医学上常说的逆转录酶抑制剂，可以让患者血清抗原减少，让cd4细胞短暂的提高，对于这个药的副作用来说，一般要看它的剂量大小，如果剂量较高的话，很有可能会引起皮疹，口炎，以及一些神经上的疾病。
第三种药对于艾滋病患者来说，尤其是艾滋病晚期患者将会更加有好处。第三种主要是进行中药治疗，用一些可以提高人体抵抗力的药物，降低一些患疾病的几率，采用的药物主要有紫花地丁，人参。这些药物对于人体来说副作用极小，如果适量饮用的话，不仅对自己的免疫力有所好处，对其他地方也有一定的好处。
对于所有艾滋病患者来说，无论是初期还是晚期，使用任何西药，对于身体来说都会有一定的副作用，最好的方法还是对自己的身体进行日常的调理，很多的病人在初期使用药物的时候，副作用会引发一些并发症，比如严重的腹泻，腹部痉挛，贫血等现象，注意都是在饭后进行使用。