传染性软疣的在医院的诊断确诊，还是比较容易的。要在有不洁净性生活之后，或者与感染者有过肌肤接触，或者间接的肌肤接触后，感觉不适，或者为了确保是否感染的情况下，应及时就医检查。
根据本病的临床上有蜡样光泽的圆形或半球形丘疹，中央脐凹状，可挤出干酪样物与组织病理具有特征样，易于诊断，生殖器部位损害有性活跃年青者，应检查有地性病，较大皮损应与基底细胞癌，角化棘皮瘤鉴别。
潜伏期2～3周，初起为帽针头至绿豆大小的半球状丘疹，表面呈蜡样光泽，中央脐窝状，为正常肤色，渐增大至豌豆大，挤之可排出白色乳酪状软疣小体， 儿童多见于颜面，躯干四肢，成人全身各处均可发生，由性传播者见于外阴，臀部，小腹及大腿内侧，也可出现于唇舌、颊黏膜、眼结膜等处，数目多少不等，散在分布，相互不融合，自觉瘙痒。
传染性软疣属于慢性病程，有自限性，持续数月可自退，多见于儿童及青年人，潜伏期为14天～6个月，初起为米粒大半球形丘疹，以后逐渐增至豌豆大，中心微凹或呈脐窝，表 面有蜡样光泽，早期质地坚韧，后逐渐变软，呈灰白色或珍珠色，可挤出白色乳酪样物质，称为软疣小体，损害数目不等，由数个至数十个，陆续出现，或少数散在，或数个簇集，互不融合，体表各部位皆可发生，好发于躯干，四肢，肩胛，阴囊和肛门等处，也可发生于唇，舌，颊黏膜及结膜，皮疹部位因接触方式不同而异，一般无自觉症状，极少数病人其损害异常巨大称为巨型软疣，有的可角化而像小的皮角，称为角化性软疣，皮损偶然可自然消失，愈后不留瘢痕。
中医病机：俗称水瘊子，中医的“鼠乳”与本病相类似，《诸病源候论》鼠乳候记述“鼠乳者，身而忽生肉，如鼠乳之状，谓之鼠乳也”，中医认为此系气血失和，腠理不密，复感外邪，凝聚肌肤而致。
本病临床及组织学均非常特殊，一般诊断不难。因此积极就医，主动检查，一般不会对生活造成困扰。